Wojownicze Żółwie Ninja, teraz przebrane za superbohaterów, stają przed nowym wyzwaniem w Nowym Jorku. Leonardo, Michał Anioł, Donatello i Raphael w powiewających pelerynach i kolorowych maskach przygotowują się do ochrony obywateli przed tajemniczym złoczyńcą, który grozi sianiem chaosu. Trenując swoje umiejętności bojowe na dachu, słyszą wołanie o pomoc dochodzące z pobliskiej ulicy. Bez wahania żółwie ruszają do akcji, wykorzystując swoje techniki ninjutsu i pracę zespołową, aby uratować sytuację. Swoją odwagą i przyjaźnią udowadniają, że nawet jako superbohaterowie prawdziwa siła leży w jedności i determinacji w walce o to, co słuszne.
