W roku 2099 Spider-Man, obecnie kultowa postać w futurystycznym kostiumie pełnym neonów i zaawansowanych gadżetów, staje w obliczu nowego zagrożenia, które może zniszczyć Nowy Jork. Z pomocą sztucznej inteligencji musi stawić czoła złoczyńcom, którzy korzystają z technologii, aby wywołać chaos. Eksplorując oświetlone drapacze chmur i ulice pełne poduszkowców, Peter Parker odkrywa, że jego pajęcze moce ewoluowały, pozwalając mu manipulować otaczającą go technologią. W wyścigu z czasem musi połączyć siły z nowymi sojusznikami i wykorzystać ich umiejętności, aby ocalić przyszłość ludzkości.
