Une nuit, les Teenage Mutant Ninja Turtles, Leonardo, Donatello, Michelangelo et Raphael, ont été surpris par un mystérieux vaisseau spatial qui a atterri à New York. Curieux et intrépides, ils décidèrent d'enquêter et, en entrant dans le vaisseau, ils furent transportés dans une galaxie lointaine. Là, ils rencontrèrent des êtres extraterrestres en difficulté, car un méchant intergalactique, le redouté Krang, avait volé la source d'énergie de la planète. Grâce à leurs talents de combattant et à leur nouvelle combinaison spatiale, les tortues s'associent aux extraterrestres pour affronter Krang et rétablir la paix dans la galaxie. L'aventure et l'amitié ne faisaient que commencer !
