Dans une galaxie lointaine, Scooby-Doo et la bande reçoivent un mystérieux appel venant d'une planète inconnue. Équipés de combinaisons spatiales, ils montent à bord de la Mystery Machine et voyagent à travers l'espace, entourés d'étoiles brillantes et de planètes colorées. En atterrissant sur la planète, le gang découvre d'étranges créatures et une ancienne légende sur un fantôme intergalactique qui hante les habitants. Avec l'aide de Scooby et Shaggy, toujours à la recherche de nourriture, Fred, Daphné et Velma enquêtent sur les mystères de la planète, découvrant des indices et affrontant des défis cosmiques. Finalement, ils découvrent que le fantôme n'était rien d'autre qu'une illusion créée par un inventeur fou qui voulait protéger sa planète. Ensemble, ils contribuent à rétablir la paix et rentrent chez eux avec une nouvelle aventure incroyable à raconter.
