Im Jahr 2099 sieht sich Spider-Man, mittlerweile eine ikonische Figur in einem futuristischen Kostüm voller Neonlichter und fortschrittlicher Geräte, einer neuen Bedrohung gegenüber, die New York City zerstören könnte. Mit Hilfe seiner künstlichen Intelligenz muss er sich Bösewichten stellen, die die Technologie ausnutzen, um Chaos zu verursachen. Während er die beleuchteten Wolkenkratzer und Straßen voller Hovercars erkundet, entdeckt Peter Parker, dass sich seine Spinnenkräfte weiterentwickelt haben und es ihm ermöglichen, die Technologie um ihn herum zu manipulieren. In einem Wettlauf gegen die Zeit muss er sich mit neuen Verbündeten zusammenschließen und deren Fähigkeiten nutzen, um die Zukunft der Menschheit zu retten.
